Christoffer Winther er træt af København og Justitsministeriet. Det passer ham derfor fint da PET beslutter at sende ham til Rio de Janeiro for at opspore en dansker, der er stukket af fra en længere fængselsstraf. I Rio trænger Christoffer dybt ind i de eksplosive slumkvarterer, og i Salvador de Bahía støder han på mørke kræfter, musik og folketro. Men nogen følger tilsyneladende efter ham ... En mand der kalder sig Ruben Costa - en rejsende i vold - får samtidig en ny opgave: Giv Brasiliens præsident en advarsel, der skal gøre ham interesseret i og afhængig af en stor oliehandel. Gisela, en smuk mystisk kvinde der er oplært i candombléreligionen, kommer Christoffer til hjælp ... Men kender han overhovedet sin egen rolle? Sort sol over Rio er en farverig, politisk spændingsroman, der indfanger det fascinerende og modsætningsfyldte Brasilien.