Mare vill inte dränka människorna, men hon måste. Hennes far Triton styr haven med järnhand och kväser varje tillstymmelse till egen vilja. För att inte förlora sig själv flyr Mare. Med uråldrig blodsmagi tar hon sig upp på land, men priset är högt. Hon måste lämna sina systrar och sin röst. Människornas värld är obegriplig, full av betong, maskiner och kalla ansikten. Samtidigt är Triton rasande, han vill till varje pris ha tillbaka sin dotter. Då får Mare hjälp från oväntat håll.
Pärlorna är en modern, grym version av den klassiska sagan av H.C. Andersen.