Handlingen i "Indlagt" udspiller sig i 1980. To mænd – med hver sit motiv – beslutter sig til at efterforske hvad der egentlig skete tre år tidligere, da formanden for EF-kommissionen, danskeren Erik Enslev forsvandt.
Den ene af de to mænd er en russisk oberst knyttet til KGB – den anden er en dansk teolog, der dengang var ansat i Bruxelles, hvor han kom til at stå Erik Enslev nær.
Teologen finder sammen med Enslevs kone og de bliver modstræbende involveret i et farligt spil omkring opklaringen af de mystiske omstændigheder i forbindelse med Enslevs forsvinden.