Skriet från hans egen strupe överraskade honom när ett hårt slag över ansiktet fällde honom till marken. Allting svartnade och han förlorade begreppet om vad som var upp och ned. När han till slut började skönja suddiga konturer omkring sig, fann han sig själv stående på alla fyra på marken, med blod rinnande från näsa och mun, och en pistolmynning riktad rakt mot sin panna.
Överhopad av skam och självömkan efter att ha blivit granskad och offentligt utskämd i en TV-intervju, tar läkaren Henry Ohlsson sin tillflykt till en avlägsen fransk hjälpstation i hjärtat av Centralafrikanska republiken. Men vistelsen där tar en helt annan vändning än han någonsin hade kunnat föreställa sig.
Fyrtioen minuter och nio sekunder är den dramatiska historien om ett land i utsatthet och konflikt, förbisedd av västvärlden, men också en berättelse om vänskap, om det oväntade och livsomvälvande mötet mellan två människor, samt om en människas kamp att resa sig från skammen och återta förlorad tro på sin egen förmåga.